Code produit : BMC-18

Principes et applications des nouvelles méthodes de séquençage à haut-débit (NGS): choisir la technologie adaptée à son projet

  • Vous saurez choisir entre les différentes méthodes de séquençage à haut débit en fonction de vos projets.
  • Vous connaitrez les grandes étapes méthodologiques du séquençage à haut débit.
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  • Evaluation
Objectifs pédagogiques

Se familiariser avec les différentes techniques de séquençage à haut-débit et acquérir une connaissance générale de leur principe de fonctionnement.
Acquérir des notions sur les différentes applications possibles des méthodes NGS et sur les spécificités de chacune des méthodes.
Comprendre les grandes étapes méthodologiques avant et après séquençage pour mieux préparer son projet de séquençage.

Programme

Les méthodes de séquençages : principes

  • Présentation des différentes méthodes de séquençage à haut-débit

  • Principe et fonctionnement

  • Capacités de séquençage

  • Comparatif des différentes méthodes, forces et faiblesses

  • Les technologies de demain

De l’échantillon à la séquence : les grandes étapes méthodologiques

  • Préparation des échantillons

    • Les différentes étapes clés méthodologiques

    • Garantir la qualité des données de séquençage

    • Penser son expérimentation

    • La production des échantillons biologiques

    • Extraction et purification des acides nucléiques

  • Captures et enrichissement

    • Principe

    • Les méthodes de capture et d’enrichissement

    • Capture d’hybrides

    • Amplification PCR

    • Immunoprécipitation

  • Autres approches méthodologiques

  • Construction des différents types de banques

    • Les étapes clés

    • Construction des banques à ADN

    • Construction des banques à partir d’ARN

    • Veille et innovation technologique

  • Préparation de banques et séquençage sur plateforme Ion Torrent PGM : exemple

L’analyse des données de séquençage

  • Introduction

  • La production des données

  • L’analyse

  • Les bases de données

  • Conclusions

Les différentes applications NGS : quelle méthode choisir en fonction de mon application ?

  • Introduction

  • La génomique structurale

  • La génomique fonctionnelle

  • Métagénomique et environnement

  • Conclusions

Bilan, discussion et questions

Formateurs

Dr. S. Hughes - Dr. B. Gillet

M. B. Gillet.

Informations complémentaires

Prérequis : AUCUN. Chaque formation donne lieu à l’envoi d’une attestation de fin de formation. En cas d’évaluation des acquis, les résultats sont communiqués. 

Public concerné

Biologistes (Chercheurs, ingénieurs, étudiants) ayant un projet NGS et souhaitant faire le point sur l’ensemble des technologies disponibles et des avantages/inconvénients de chacune en fonction des projets.

 

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Contact Formation Interentreprises
Thi Narin THACH
Chargée de Missions
Tél : 01 41 10 26 22

t.thach@ifis.fr

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Lisa FERNANDEZ
Chargée de Relations Clientèle
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l.fernandez@ifis.fr